Tota aquesta història comença amb la mudança de la família de Coraline, ella des del principi està disgustada, ja que ha deixat enrere als seus antics amics. En la nova casa, els seus pares no li paren esment, això fa que Coraline se senti sola i avorrida, i comença a veure el veïnat, i descobreix que els seus veïns són estranys, i finalment es fa amiga de Wybie, encara que ella pensa que l'és molt molest i insuportable, ja que no deixa de parlar. Així que ella se sent molt més disgustada i infeliç amb la seva nova vida.

Un dia, Coraline se sent avorrida així que investiga la seva casa, i s'adona que a la seva habitació hi ha una petita porta, ella l'obre, i s'obre un portal, que li porta a un altre món, que és semblant al seu, encara que per a ella, aquest món és mil vegades millor al seu. En aquest món, els seus pares tenen botons als ulls, que li sembla molt estrany a Coraline, però, li presten atenció, el menjar és deliciós, els jardins de la casa també són bonics i els veïns també són més amables, la seva mare fa realitat tots els seus desitjos, per exemple, ella diu que Wybie és molt molest, així que la seva mare li cus la boca. Tot perquè Coraline es quedi per sempre en aquest món amb la condició de que ella porti també botons als ulls, cosa que Coraline denega, encara que els pares continuen insistint en que els porti per viure sempre en aquell món.

Totes les nits, Coraline viatja a aquest món, però a poc a poc, ella s'adona que, en aquest món tot no és tan perfecte com sembla, l'ambient comença a ser inquietant, i descobreix que aquest món és molt més fosc del que sembla, llavors ella intenta tornar a la seva casa, i s'adona que el portal està tancat, i es quedarà tancada en aquest món per sempre, així que farà tot el possible per a tornar al seu món.

Llavors la història es torna més inquietant, i l'estètica innocent del principi, desapareix i deixa una més tètrica que ens fa entendre que a vegades les aparences enganyen i que tot no és tan perfecte com sembla.